Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAP3Q9H6T3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAP3Q9H6T3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms