Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCAD1Q9H4L7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCAD1Q9H4L7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms