Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00597Q9H2U6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms