Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG9Q9H0W8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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