Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP44Q9H0E7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP44Q9H0E7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP44Q9H0E7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms