Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM5DQ9BY66 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5DQ9BY66 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms