Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI3

NT5C1A, Cytosolic 5'-nucleotidase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1AQ9BXI3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NT5C1AQ9BXI3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NT5C1AQ9BXI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NT5C1AQ9BXI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms