Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA9Q9BWV2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPATA9Q9BWV2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms