Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBM4Q9BWF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4Q9BWF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4Q9BWF3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms