Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TIPINQ9BVW5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIPINQ9BVW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPINQ9BVW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms