Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSRP1Q9BUV0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSRP1Q9BUV0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms