Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCMBPQ9BTE3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCMBPQ9BTE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms