Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCM2Q9BSQ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms