Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM79Q9BSE2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM79Q9BSE2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms