Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM56Q9BRZ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM56Q9BRZ2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms