Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00467Q9BRT7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00467Q9BRT7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms