Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FYCO1Q9BQS8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms