Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MEIS3Q99687 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEIS3Q99687 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS3Q99687 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms