Protein–RNA interactions for Protein: Q96S90

LYSMD1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD1Q96S90 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD1Q96S90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD1Q96S90 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYSMD1Q96S90 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms