Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSRNP1Q96S65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CSRNP1Q96S65 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms