Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK15Q96Q40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK15Q96Q40 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms