Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALS2CR12Q96Q35 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALS2CR12Q96Q35 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms