Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCGB3A2Q96PL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB3A2Q96PL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms