Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLRP4Q96MN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP4Q96MN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP4Q96MN2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP4Q96MN2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms