Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NSMCE3Q96MG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE3Q96MG7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms