Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf85Q96MD7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf85Q96MD7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms