Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNIP3Q96KP6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNIP3Q96KP6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms