Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF496Q96IT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF496Q96IT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF496Q96IT1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms