Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIPA1Q96FS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms