Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MRPL53Q96EL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL53Q96EL3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms