Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM3DQ96BQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM3DQ96BQ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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