Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTSSAQ969W0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPTSSAQ969W0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms