Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF34Q969K3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF34Q969K3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF34Q969K3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms