Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED12Q93074 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED12Q93074 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED12Q93074 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED12Q93074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED12Q93074 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED12Q93074 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED12Q93074 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MED12Q93074 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED12Q93074 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED12Q93074 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED12Q93074 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED12Q93074 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED12Q93074 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED12Q93074 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED12Q93074 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED12Q93074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms