Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF4BQ92750 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF4BQ92750 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms