Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPGAT1Q92604 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms