Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASKIN2Q8WXE0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms