Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRIM41Q8WV44 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
TRIM41Q8WV44 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms