Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2AF1L4Q8WU68 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
U2AF1L4Q8WU68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L4Q8WU68 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms