Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB3L4Q8TEY5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CREB3L4Q8TEY5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms