Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPBAR1Q8TDU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPBAR1Q8TDU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPBAR1Q8TDU6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms