Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HAVCR2Q8TDQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HAVCR2Q8TDQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms