Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMBQ8TAX9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMBQ8TAX9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms