Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC148Q8NFR7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC148Q8NFR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms