Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46DQ8NEK8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms