Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPC24Q8NBT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPC24Q8NBT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms