Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFSD2AQ8NA29 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2AQ8NA29 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms