Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM71DQ8N9W8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM71DQ8N9W8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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