Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL6Q8N841 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL6Q8N841 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL6Q8N841 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms