Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRACR2BQ8N4Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms